Cet outil prédit la propagation du Covid-19 en Afrique

PERSONNEL D’ADF

Le Dr Joseph Muvawala s’est présenté devant des journalistes ougandais le 7 juillet avec plusieurs pages remplies de chiffres sur les cas de Covid-19, et avec un message sérieux.

Il a déclaré : « Le confinement fonctionne. »

Le directeur exécutif de l’Autorité de planification nationale (NPA) de l’Ouganda base sa certitude sur les données provenant d’un outil qui fournit des prédictions bihebdomadaires des nouvelles infections et aide les autorités de santé à décider s’il faut mettre en œuvre ou modifier des contre-mesures.

L’autorité a collaboré avec une équipe internationale de scientifiques conduite par un groupe de l’université d’État de Pennsylvanie aux États-Unis pour développer l’outil pour les pays africains.

Il utilise les données disponibles des cas positifs, de la population, de la situation économique, des efforts actuels d’atténuation et des données météorologiques satellitaires pour projeter comment le Covid-19 pourrait se propager.

Les scientifiques ont créé une série d’outils visuels faciles à interpréter, les ont placés en ligne avec un code à source ouverte et ont travaillé étroitement avec les planificateurs et les économistes ougandais sur leur mise en œuvre.

Le professeur Steven Schiff, chef de projet qui a fondé le Centre pour la neuro-ingénierie à Penn State, a travaillé pendant quinze ans avec les hôpitaux ougandais, les planificateurs, les économistes et les responsables politiques sur la cartographie prédictive des infections infantiles et des anomalies congénitales.

Il a dit dans un article sur le site web de Penn State : « Lorsque la pandémie du Covid-19 a commencé, nous avions cette équipe peu ordinaire de scientifiques qui travaillaient dur sur la mise en œuvre de la P3H (santé publique prédictive, personnalisée) en Afrique. »

« Nous avons pensé que nous pourrions contribuer beaucoup à la lutte contre ce nouveau virus. Il était crucial de nous assurer d’avoir un cadre que les responsables politiques pourraient utiliser et appliquer à leurs travaux. »

L’équipe du professeur Schiff inclut Paddy Ssentongo, professeur de recherche adjoint de science de l’ingénierie et de mécanique, originaire de l’Ouganda.

Le professeur Ssentongo déclare que la dynamique diversifiée du Covid-19 en Afrique nécessite un outil qui pourrait capturer et interpréter des données complexes.

« Si nous attendons simplement que les patients deviennent malades du Covid-19, nous sommes déjà perdants, dit-il. La prévention est la meilleure chose à faire. »

Abraham Muwanguzi, chef de la science et la technologie chez NPA, a travaillé avec les scientifiques et a soumis l’outil de modélisation au ministère de la Santé de l’Ouganda pour l’analyse des tendances du Covid-19.

Cela a eu des implications majeures dans le monde réel.

« En septembre et octobre 2020, au point culminant des cas positifs de Covid-19, le modèle a projeté une augmentation des cas transfrontaliers, ce qui a incité le gouvernement à fermer les frontières, dit-il. Nous avons constaté moins de cas que prévu parce que nous avons pu atténuer une source prédite qui avait été bien capturée dans le modèle. »

L’outil aide aussi le pays à prévoir comment affecter les ressources.

« En mars et avril de cette année, le modèle a projeté une énorme chute du nombre de cas, déclare le Dr Muwanguzi. Nos centres hospitaliers ont commencé à se vider : il y avait réellement moins de cas positifs. Nous avons donc pu réduire nos activités et réaffecter des ressources aux autres secteurs nécessiteux. »

Mais le 18 juin, l’Ouganda a lancé un confinement de 42 jours après la hausse des nouveaux cas, de moins de 100 à la fin mai à près de 2.000. La semaine suivant le début du confinement, le modèle a projeté 11.222 nouveaux cas si aucune contre-mesure n’était adoptée.

La NPA déclare que les prédictions de l’outil se sont révélées exactes à 97 %.

Mais ces prédictions sont seulement aussi bonnes que les données qui sont fournies.

« Nous espérons que d’autres pays d’Afrique non seulement utiliseront cet outil mais aussi collaboreront pour s’assurer qu’ils intègrent leurs données de dépistage et de rapport des cas, déclare le professeur Ssentongo. L’outil est une carte routière qui indique à un pays comment la pandémie évolue et où se dirige le pays. »

« Il est utile si le pays reçoit des projections, met en œuvre des efforts d’atténuation, puis constate une baisse des cas actuels. »